Coronavirus relacionats amb la síndrome respiratòria aguda greu

Espècie de coronavirus relacionats amb la Síndrome respiratòria aguda greu
Aquest article tracta sobre una espècie de coronavirus que inclou múltiples soques. Per a la varietat que causa SARS, vegeu SARS-CoV. Per a la varietat que causa COVID-19, vegeu SARS-CoV-2.

Els coronavirus relacionats amb la síndrome respiratòria aguda greu (SARSr-CoV) són una espècie de virus que infecta humans, ratpenats i altres mamífers. Es tracta de virus d'ARN monocatenari de sentit positiu amb embolcall que entren a la cèl·lula hoste en unir-se al receptor ACE2.[1] Pertanyen al gènere dels Betacoronavirus, de la subfamília Orthocoronavirinae (coronavirus), dins de la família Coronaviridae.[2]

Infotaula d'ésser viuCoronavirus relacionats amb la síndrome respiratòria aguda greu
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus Modifica el valor a Wikidata

Modifica el valor a Wikidata
Enregistrament

Modifica el valor a Wikidata
Dades
Hoste
Genomavirus d'ARN monocatenari positiu, virus d'ARN monocatenari positiu i virus d'ARN monocatenari positiu Modifica el valor a Wikidata
Malaltiainfecció per coronavirus Modifica el valor a Wikidata
Taxonomia
RegneOrthornavirae
FílumPisuviricota
ClassePisoniviricetes
OrdreNidovirales
FamíliaCoronaviridae
GènereBetacoronavirus
EspècieSevere acute respiratory syndrome-related coronavirus Modifica el valor a Wikidata
Nomenclatura
Sinònims
Severe acute respiratory syndrome coronavirus Modifica el valor a Wikidata

Dues soques d'aquesta espècie han provocat brots de malalties respiratòries greus en humans: el SARS-CoV, que va causar un brot de síndrome respiratòria aguda severa (SARS) entre el 2002 i el 2003, i SARS-CoV-2, que des de finals del 2019 ha provocat una pandèmia per coronavirus (causant de la COVID-19).[3][4] A part de les dues mencionades anteriorment, hi ha centenars d'altres soques de SARSr-CoV, totes elles només conegudes per infectar espècies no humanes: els ratpenats són un reservori important de moltes soques de coronavirus relacionades amb el SARS, i s'han identificat diverses soques en civetes (Paradoxurus), que probablement foren els ancestres del SARS-CoV.[5][3]

Els coronavirus relacionats amb el SARS van ser uns dels diversos virus identificats per l'Organització Mundial de la Salut el 2016 com a probable causa d'una futura epidèmia en un nou pla desenvolupat després del brot d'Ebola a l'Àfrica de l'oest de 2014, per a recerca i desenvolupament d'urgència de proves de diagnòstic, vacunes i medicaments. La predicció va esdevenir un fet amb la pandèmia per coronavirus de 2019-2020.

Classificació modifica

 
Esquema de l'estructura del virió dels coronavirus. S'observen protuberàncies que formen una mena de "corona" semblant a la corona solar, origen del nom de la família.

Els coronavirus relacionats amb el SARS (SARSr-CoV) pertanyen al gènere betacoronavirus (grup 2) i al subgènere Sarbecovirus (subgrup B).[6] Els sarbecovirus, a diferència dels embecovirus o els Alphacoronavirus, només tenen una proteïnasa similar a la papaïna (PLpro) en lloc de dues en el marc obert de lectura ORF1.[7] Els SARSr-CoV van ser determinats com una primera divisió dels betacoronavirus ja que tenen un conjunt de dominis conservats que comparteix amb el grup.[7][8]

Ordre Nidovirales

Reservori natural i zoonosi modifica

Els ratpenats són el principal reservori hoste per als SARSr-CoV. El virus ha coevolucionat amb el seus hostes ratpenats durant un llarg període.[9]

Ha estat recentment quan les SARSr-CoV han evolucionat per fer la transmissió entre espècies (salt d'hoste) dels ratpenats als humans, com en el cas de les soques SARS-CoV i SARS-CoV-2.[10][11] Ambdues soques descendeixen d'un avant-passat comú, però van fer la zoonosi mitjançant espècies creuades cap als humans per separat i de formes diferents. El SARS-CoV-2 no és descendent directe de SARS-CoV.[5] El 17 de març de 2020, la comunitat científica van informar que el nou virus SARS-CoV-2 es va originar de manera natural, sense intervenció artificial (descartant així qualsevol hipòtesi de bioterrorisme), originari d'un coronavirus de ratpenat emprant com a hoste intermedi un pangolí.[12][13]

Referències modifica

  1. Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung «Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis» (en anglès). Viruses, 2, 8, 24-08-2010, pàg. 1804–1820. DOI: 10.3390/v2081803. ISSN: 1999-4915. PMC: PMC3185738. PMID: 21994708.
  2. 2,0 2,1 «International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)» (en anglès). ICTV, 02-2019. [Consulta: 23 març 2020].
  3. 3,0 3,1 Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses «The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2» (en anglès). Nature Microbiology, 02-03-2020. DOI: 10.1038/s41564-020-0695-z. ISSN: 2058-5276.
  4. Cohen, Jon; Kupferschmidt, Kai «Strategies shift as coronavirus pandemic looms» (en anglès). Science, 367, 6481, 28-02-2020, pàg. 962–963. DOI: 10.1126/science.367.6481.962. ISSN: 0036-8075.
  5. 5,0 5,1 Lau, S. K. P.; Li, K. S. M.; Huang, Y.; Shek, C.-T.; Tse, H. «Ecoepidemiology and Complete Genome Comparison of Different Strains of Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Rhinolophus Bat Coronavirus in China Reveal Bats as a Reservoir for Acute, Self-Limiting Infection That Allows Recombination Events» (en anglès). Journal of Virology, 84, 6, 15-03-2010, pàg. 2808–2819. DOI: 10.1128/JVI.02219-09. ISSN: 0022-538X.
  6. Wong, Antonio; Li, Xin; Lau, Susanna; Woo, Patrick «Global Epidemiology of Bat Coronaviruses» (en anglès). Viruses, 11, 2, 20-02-2019, pàg. 174. DOI: 10.3390/v11020174. ISSN: 1999-4915. PMC: PMC6409556. PMID: 30791586.
  7. 7,0 7,1 Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung «Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis» (en anglès). Viruses, 2, 8, 24-08-2010, pàg. 1804–1820. DOI: 10.3390/v2081803. ISSN: 1999-4915. PMC: PMC3185738. PMID: 21994708.
  8. «Coronaviridae - Figures - Positive Sense RNA Viruses - Positive Sense RNA Viruses» (en anglès). ICTV, 2011. Arxivat de l'original el 2020-01-16. [Consulta: 24 març 2020].
  9. Gouilh, Meriadeg Ar; Puechmaille, Sébastien J.; Gonzalez, Jean-Paul; Teeling, Emma; Kittayapong, Pattamaporn «SARS-Coronavirus ancestor’s foot-prints in South-East Asian bat colonies and the refuge theory» (en anglès). Infection, Genetics and Evolution, 11, 7, 01-10-2011, pàg. 1690–1702. DOI: 10.1016/j.meegid.2011.06.021. ISSN: 1567-1348.
  10. Cui, Jie; Han, Naijian; Streicker, Daniel; Li, Gang; Tang, Xianchun «Evolutionary Relationships between Bat Coronaviruses and Their Hosts - Volume 13, Number 10—October 2007 - Emerging Infectious Diseases journal - CDC» (en anglès). CDC - Emerging Infectious Diseases, 10-10-2017. DOI: 10.3201/eid1310.070448.
  11. Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian «Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor» (en anglès). Nature, 503, 7477, 2013-11, pàg. 535–538. DOI: 10.1038/nature12711. ISSN: 1476-4687.
  12. Andersen, Kristian G.; Rambaut, Andrew; Lipkin, W. Ian; Holmes, Edward C.; Garry, Robert F. «The proximal origin of SARS-CoV-2» (en anglès). Nature Medicine, 17-03-2020, pàg. 1–3. DOI: 10.1038/s41591-020-0820-9. ISSN: 1546-170X.
  13. Zhang, Tao; Wu, Qunfu; Zhang, Zhigang «Pangolin homology associated with 2019-nCoV» (en anglès). bioRxiv, 20-02-2020, pàg. 2020.02.19.950253. DOI: 10.1101/2020.02.19.950253.