Una repetició inversa (IR, de l'anglès inverted repeat) és una seqüència de nucleòtids que és el complement invers d'una altra seqüència que es troba riu avall.

Per exemple, 5'---GACTGC....GCAGTC---3'. Quan no hi ha nucleòtids entre la seqüència i el seu complement riu avall és anomenat palíndrom. Els inverted repeats defineixen els marges dels transposons. Els inverted repeats també són indicadors de regions capaces d'autoaparellar-se (regions amb una sola seqüència en la que els parells de bases es poden aparellar entre ells). A tall d'exemple: