El projecte 'The All-Species Living Tree' Project és una col·laboració entre diversos grups/instituts acadèmics, com ARB, SILVA i LPSN, amb la finalitat de realitzar una base de dades de seqüències d'ARNr 16S de totes les espècies conegudes d'eubacteris i arqueobacteris.[1] Inicialment també es recol·lectaven les seqüències 23S,[2] però es va deixar de fer. Actualment hi ha més d'11.000 espècies alineades i diverses més estan sent afegides així que noves espècies van sent descobertes, cultivades i seqüenciades.
L'arbre va ser creat per ML sense bootstrap: conseqüentment la interrelació entre diversos fílums no està realment clara (com és el cas dels firmicuts). Els eucariotes no estan representats en l'anàlisi.
- ↑ Yarza, P.; Richter, M.; Peplies, J. R.; Euzeby, J.; Amann, R.; Schleifer, K. H.; Ludwig, W.; Glöckner, F. O.; Rosselló-Móra, R. «The All-Species Living Tree project: A 16S rRNA-based phylogenetic tree of all sequenced type strains». Systematic and Applied Microbiology, 31, 4, 2008, pàg. 241–250. DOI: 10.1016/j.syapm.2008.07.001. PMID: 18692976.
- ↑ Yarza, Pablo; Ludwig, Wolfgang; Euzéby, Jean; Amann, Rudolf; Schleifer, Karl-Heinz; Glöckner, Frank Oliver; Rosselló-Móra, Ramon «Update of the All-Species Living Tree Project based on 16S and 23S rRNA sequence analyses». Systematic and Applied Microbiology, 33, 6, 2010, pàg. 291–299. DOI: 10.1016/j.syapm.2010.08.001. PMID: 20817437.
Enllaços externs
modifica
