El 6 de novembre de 1999 es van celebrar eleccions presidencials al Tadjikistan. Les va guanyar l'actual president, Emomalí Rahmonov, que va obtenir el 98% dels vots. L'oposició, que havia exigit l'ajornament de les eleccions[1] i pensava boicotejar-les (però es va retractar unes hores abans que comencés la votació), va qualificar el resultat d'il·legal.[2] Els observadors estrangers també es van mostrar crítics amb les eleccions, sobretot pel que fa a les qüestions del registre de candidats, l'accés als mitjans de comunicació i les irregularitats en la votació, inclòs el vot múltiple.[3]
Es va informar que la participació va ser del 99% dels 2.866.578 milions de votants registrats.[4]