Huancayo va ser establerta com la capital d'aquesta província. El [[15 de gener]] de [[1931]] segons decret del Luis Miguel Sánchez Cerro, Huancayo va ser nomenada capital del [[Regió de Junín|departament de Junín]] en substitució de la ciutat de Cerro de Pasco que va passar a ser la capital del recentment creat [[departament de Pasco]]. Aquest fet va establir a Huancayo com la ciutat més important de la regió central del país, condició que es va anar consolidant durant el [[segle XX]].
A la [[Dècada del 1980|dècada del 80]], Huancayo a l'igual que tota la regió central del país, va ser un centre de lluita antisubersiva contra les organitzacions [[Terrorisme|terroristes]] de [[Partit Comunista del Perú|Sendera Lluminosa]] i el [[Moviment Revolucionari Túpac Amaru|MRTA.]] A la ciutat es registraren constants enfrontaments entre les [[Forces Armades del Perú|Forces Armades]] i aquestes dues faccions, les mateixes que fins i tot s'enfrontaven una a una altra. L'est de la ciutat es trobava sota el control de Sendera mentre que l'oest de la mateixa es trobava sota el control del MRTA. L'any [[1988]] es va capturar a la "Plaça Huamanmarca" al cap del MRTA, Víctor Polay Campos. A partir de l'any [[1992]], al mateix temps que a la resta del país, les Forces Armades van aconseguir desarticular el moviment subversiu. Finalment el [[14 de juliol]] de [[1999]], es va aconseguir la captura de l'últim cap de Sendera Lluminosa Oscar Ramirez Durand, àlies Feliciano, en la localitat de Cochas, annex del districte del Tambo.<ref name="EMI Feliciano caputardo">{{ref-web|cognom= chimbote es mejor|nom= El Mundo, INTERNACIONAL|enllaçautor= |títol= Fujimori anuncia la captura de «Feliciano», el máximo dirigente de Sendero Luminoso|any= 2008|edició= |lugar = |editor= |ID = |url = http://www.elmundo.es/1999/07/15/internacional/15N0034.html|consulta= 24/08/08}}</ref>
