Revisió del 14:13, 6 maig 2018 modifica ArnauBot (discussió \| contribucions) Bots 660.208 edits Robot estandarditza i catalanitza referències, catalanitza dates i fa altres canvis menors ← Edició anterior		Revisió del 13:46, 8 set 2018 modifica desfés CarlesMartin (discussió \| contribucions) Administradors 434.590 edits Canvis menors, neteja, replaced: <references /> → {{referències}}, el tamany → la mida AWB Edició següent →
Línia 1: {{Infotaula de lloc web}} El '''Sistema de Llenguatge Mèdic Unificat''' (en [[anglès]], '''''Unified Medical Language System''''', '''UMLS''') és un [[compendi]] de molts [[Vocabulari controlat\|vocabularis controlats]] de les ciències [[Biomedicina\|biomèdiques]], creat el 1986.<ref>{{citar ref\|títol=Unified Medical Language System\|url= https://www.nlm.nih.gov/archive/20040831/pubs/cbm/umlscbm.html\|any=1996}}</ref> L'UMLS consisteix en fonts de coneixement ([[Base de dades\|bases de dades]]) i un conjunt d'eines de [[programari]]; el sistema està destinat a ser utilitzat principalment per desenvolupadors de sistemes d'[[informàtica biomèdica]]. També proporciona la base per al [[Processament de llenguatge natural\|processament del llenguatge natural]]; proporciona una estructura de mapatge entre aquests vocabularis i, per tant, permet traduir paraules entre els diferents sistemes de terminologia. També es pot considerar un [[tesaurus]] i un diccionari d'[[ontologia]] integral de conceptes biomèdics. Línia 12: == Llicències == Els usuaris del sistema han de signar un ''«UMLS agreement»'' (d'acord amb l'UMLS) i presentar informes breus d'ús anual. Els usuaris acadèmics poden utilitzar gratuïtament l'UMLS amb finalitats de recerca i investigació. L'ús comercial o de producció requereix llicències de [[drets d'autor]] per a algunes de les fonts dels vocabularis incorporats. Línia 20: == Fonts de coneixement == === ''Metathesaurus'' === El ''Metathesaurus'' forma la base de l'UMLS i comprèn més d'1 milió de conceptes biomèdics i 5 milions de noms conceptuals, tots ells derivats dels més de 100 vocabularis i sistemes de classificació controlats incorporats. Alguns exemples dels vocabularis controlats incorporats són [[ICD-10]], [[Medical Subject Headings\|MeSH]], [[SNOMED CT]], [[DSM-IV]], [[LOINC]], [[WHO Adverse Drug Reaction Terminology]], [[UK Clinical Terms]], [[RxNorm]], [[Gene Ontology]] i [[OMIM]]''.'' El Metathesaurus s'organitza per concepte, i cada concepte té atributs específics que defineixen el seu significat i estan vinculats als noms de conceptes corresponents en els diferents vocabularis de la font. Es representen nombroses relacions entre els conceptes, per exemple, jeràrquics com «[[Is-a (ciència de la computació)\|is-a]]» per a les subclasses i «són part de» per a les subunitats, i els associatius com «són causats per» o «en la literatura es produeix gairebé sovint''»'' (aquesta última es deriva de [[MEDLINE]]). L'abast del Metathesaurus està determinat per l'abast dels vocabularis d'origen. Si diferents vocabularis utilitzen noms diferents per al mateix concepte, o si utilitzen el mateix nom per a diferents conceptes, aquest serà representat fidelment en el Metathesaurus. Tota la informació jeràrquica dels vocabularis d'origen es conserva al Metathesaurus. Els conceptes del Metathesaurus també es poden enllaçar a recursos fora de la base de dades, per exemple, a la bases de dades de seqüència de [[~~Gen\|gens~~gen]]s. === ''Semantic Network'' === A cada concepte en el Metathesaurus s'assigna a un o més tipus semàntics (categories), que estan vinculats entre ells a través de relacions semàntiques.<ref name="UMLSRM2009Ch5">{{ref-llibre\|títol= UMLS Reference Manual\| editorial= U.S. National Library of Medicine, National Institutes of Health\|lloc= Bethesda, MD\|autor= National Library of Medicine\|any= 2009\|capítol= Chapter 5 - Semantic Networks\| url = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/ }}</ref> El ''Semantic Network'' ([[xarxa semàntica]]) és un catàleg d'aquests tipus i relacions semàntiques. Aquesta és una classificació bastant àmplia; en total hi ha 127 tipus semàntics i 54 relacions. Línia 35: === ''SPECIALIST Lexicon'' === L'''SPECIALIST Lexicon'' conté informació sobre vocabulari en [[anglès bàsic]] de termes biomèdics, termes trobats en MEDLINE i termes trobats en l'UMLS Metathesaurus. Cada entrada conté [[sintaxi]] (com es combinen les paraules per crear significats), [[Morfologia (lingüística)\|morfologia]] (forma i estructura) i [[ortografia]] (escriptura correcta). Un conjunt de programes [[Java (llenguatge de programació)\|Java]] utilitza el lèxic per a treballar a través de les variacions en els textos biomèdics relacionant paraules entre les seves parts del llenguatge, que poden ser útils en cerques [[World Wide Web\|web]] o en cerques a través d'una [[història clínica informatitzada]]. Línia 43: * parts del discurs (de les quals l'especialista reconeix «onze»); * un identificador únic; * qualsevol variant ortogràfica disponible. Per exemple, una [[Recuperació d'informació\|consulta]] per a «[[anestèsia]]» retornaria el següent:<ref>Browne, McCray and Srinivasan (2000). [http://lexsrv3.nlm.nih.gov/LexSysGroup/Projects/lexicon/2003/release/LEXICON/DOCS/techrpt.pdf The Specialist Lexicon]. Lister Hill National Center for Biomedical Communications, National Library of Medicine, Bethesda, MD, p. 1. Línia 67: == Inconsistències i altres errors == Donada ella ~~tamany~~mida i la complexitat de l'UMLS i la seva política permissiva sobre la integració de termes, els errors són inevitables.<ref name="MorreyEtAl2009">{{ref-publicació\|cognom1=Morrey\|cognom2=Geller\|cognom3=Halper\|cognom4=Perl\|títol=The Neighborhood Auditing Tool: A hybrid interface for auditing the UMLS\|publicació=Journal of Biomedical Informatics\|volum=42\|any=2009\|pàgines=468–489\|doi=10.1016/j.jbi.2009.01.006\|pmid=19475725\|nom1=CP\|nom2=J\|nom3=M\|nom4=Y\|exemplar=3\|pmc=2891659}}</ref> Els errors inclouen l'[[ambigüitat]] i la [[Redundància lingüística\|redundància]], els cicles de relació jeràrquica (un concepte és alhora un avantpassat i un descendent), mancança d'avantpassats (els tipus semàntics de conceptes de pare/fill no estan relacionats) i la inversió semàntica (la relació de pare/fill amb els tipus semàntics és no coherent amb els conceptes).<ref>{{ref-publicació\|cognom1= Geller\|cognom2= Morrey\|cognom3= Xu\|cognom4= Halper\|cognom5= Elhanan \|cognom6= Perl\|cognom7= Hripcsack \|publicació= AMIA Annu Symp Proc\|títol= Comparing Inconsistent Relationship Configurations Indicating UMLS Errors\|any= 2009\|volum= 2009\|pàgines= 193–197\| pmc = 2815406\| pmid=20351848\|nom1= J\|nom2= CP\|nom3= J\|nom4= M\|nom5= G\|nom6= Y\|nom7= G}}</ref> Aquests errors es detecten i es resolen mitjançant l'[[auditoria]] de l'UMLS. Les auditories manuals poden ser molt lentes i costoses. Els investigadors han intentat abordar el tema a través de diverses maneres. Les eines automatitzades es poden utilitzar per buscar aquests errors. Línia 80: \| ''MetaMap'' - eina en línia que, quan es dóna un text arbitrari, troba i retorna els conceptes rellevants de Metathesaurus. \| ''MetaMap Transfer (MMTx)'' - Implementació de Java de MetaMap (ja no és compatible). \| ''Knowledge Source Server'' - accés als vocabularis basat en web (retirat el 2010).<ref>{{ref-web\|títol=Unified Medical Language System® (UMLS®) News: Revised License Agreement, New UMLS Terminology Services and Browser, Discontinued UMLSKS, and API Changes\|url= https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ja10/ja10_umls_news.html\|obra=NLM Technical Bulletin\| editor=U.S. National Library of Medicine\|data= 29 juliol 2010}}</ref> }} Línia 88: * [http://atlas.ahc.umn.edu UMLS-Similarity web interface], una interfície web semblant a l'UMLS. == Referències == {{referències}} ~~<references />~~ == Bibliografia == Línia 100: \|edició= 2nd \|capítol= Chapter 17 - Healthcare terminologies and classification systems \| editorial= Modder, Arnold \| isbn = 0-340-76425-2}} * {{ref-publicació\|cognom1= Mougin \|nom1= Fleur\|cognom2= Bodenreider \|nom2= Oliver\|any= 2005\|títol= Approaches to Eliminating Cycles in the UMLS Metathesaurus: Naïve vs. Formal\|publicació= AMIA Annual Symposium Proceedings\|pàgines= 550–554\| pmc = 1560864\| pmid=16779100}} == Enllaços externs == * {{~~Official website~~oficial\|https://www.nlm.nih.gov/research/umls/}} {{en}} * [https://www.nlm.nih.gov/research/umls/about_umls.html UMLS Summary description], amb enllaços a fitxes i documentació per a Metathesaurus, Semantic Network, SPECIALIST Lexicon i MetamorphoSys {{en}} * [https://www.nlm.nih.gov/research/umls/pdf/AMIA_T12_2006_UMLS.pdf UMLS Overview and Tutorial], by Rachel Kleinsorge, Jan Willis, Allen Browne, Alan Aronson {{PDF}} {{en}} Línia 111: {{autoritat}} [[Categoria:Bases de dades mèdiques]]

Unified Medical Language System: diferència entre les revisions