La fauna de la comarca és molt diversa. Hom troba la [[fagina]], la [[guineu]], el [[cabirol]], el [[conill]], la [[llebre]], la [[geneta]] i el [[llop]], recentment detectat a la comarca.<ref>{{Ref-web|url=http://www.ccma.cat/324/unes-fotografies-confirmen-la-presencia-del-llop-al-pirineu/noticia/2724749/|títol=Unes fotografies confirmen la presència del llop al Pirineu|consulta=8 d'abril de 2016|llengua=| editor=Corporació Catalana de Mitjans Audiovisuals|data=}}</ref> Pel que fa als ocells, destaquen el [[Gran duc|duc]] (''[[Bubo bubo]]''), l'[[Àliga marcenca|l'àliga marcenca]] (''Circaetus gallicus'') i [[Àliga cuabarrada|l'[[àliga cuabarrada]] (''Hieraaetus fasciatus''). Als rius també hi ha [[cranc de riu|el cranc de riu]] (''[[Austropotamobius pallipes]]'') i la [[llúdriga]] (''L.Lutra Lutralutra''), així com altres peixos autòctons com la [[bagra]] ''(Leuciscus cephalus'') o el [[barb cua-roig]] (''[[Barbus haas''ihaasi]]). També hi ha [[amfibi]]s, com la [[salamandra]], el [[tòtil]], la [[granota verda]] i la [[reineta]], aquestaquesta última especialment present al municipi de l'[[l'Estany|Estany]]. {{CN}}
