Arqueobacteris: diferència entre les revisions

Originalment, només es classificaren els [[metanogen|metanògens]] en aquest nou domini, i els arqueobacteris eren considerats extremòfils que només viuen en hàbitats com ara [[aigües termals]] i [[llac salat|llacs salats]]. A finals del segle XX, els microbiòlegs s'adonaren que els arqueobacteris són un grup d'organismes gran i divers àmpliament distribuïts a la [[natura]], i que són comuns en hàbitats molt menys extrems, com ara sòls i oceans.<ref name=DeLong>{{ref-publicació |autor=DeLong EF |article=Everything in moderation: archaea as 'non-extremophiles' |publicació=Curr. Opin. Genet. Dev. |volum=8 |exemplar=6 |pàgines=649–54 |any=1998 |pmid=9914204 |doi=10.1016/S0959-437X(98)80032-4}}</ref> Aquesta nova presa de consciència de la importància i l'omnipresència vingué de l'ús de la [[reacció en cadena de la polimerasa]] per detectar procariotes en mostres d'aigua o sòl a partir únicament dels seus [[àcids nucleics]]. Això permet detectar i identificar organismes que no poden ser [[cultiu microbiològic|cultivats]] al laboratori, que sol ser difícil.<ref>{{ref-publicació |autor=Theron J, Cloete TE |article=Molecular techniques for determining microbial diversity and community structure in natural environments |publicació=Crit. Rev. Microbiol. |volum=26 |exemplar=1 |pàgines=37–57 |any=2000 |pmid=10782339 |doi=10.1080/10408410091154174}}</ref><ref>{{ref-publicació |autor=Schmidt TM |article=The maturing of microbial ecology |publicació=Int. Microbiol. |volum=9 |exemplar=3 |pàgines=217–23 |any=2006 |pmid=17061212 |url=http://www.im.microbios.org/0903/0903217.pdf}}</ref>

 

{{principal|Classificació científica|sistemàtica}}

La classificació dels arqueobacteris, i dels procariotes en general, és un camp en constant moviment i controvertit. Els sistemes actuals de classificació intenten organitzar els arqueobacteris en grups d'organismes que comparteixen trets estructurals i avantpassats comuns.<ref name=Gevers>{{ref-publicació |autor=Gevers D, Dawyndt P, Vandamme P, ''et al''. |article=Stepping stones towards a new prokaryotic taxonomy |publicació=Philos. Trans. R. Soc. Lond., B, Biol. Sci. |volum=361 |exemplar=1475 |pàgines=1911–6 |any=2006 |pmid=17062410 |doi=10.1098/rstb.2006.1915 |url=http://journals.royalsociety.org/openurl.asp?genre=article&doi=10.1098/rstb.2006.1915}}</ref> Aquestes classificacions es basen significativament en l'ús de seqüències de gens d'[[ARN ribosòmic]] per revelar les relacions entre els organismes ([[filogènia molecular|filogenètica molecular]]).<ref name=Robertson/> La majoria d'espècies d'arqueobacteris cultivables i ben investigades són membres de dos fílums principals, els [[euriarqueot]]s i [[crenarqueot]]s. S'han proposat temptativament altres grups. Per exemple, a la peculiar espècie ''[[Nanoarchaeum|Nanoarchaeum equitans]]'', que fou descoberta el 2003, se li ha atribuït el seu propi fílum, el dels [[nanoarqueot]]s.<ref>{{ref-publicació |autor=Huber H, Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO. |article=A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont |publicació=Nature |volum=417 |exemplar=6884 |pàgines=27–8 |any=2002 |pmid=11986665 |doi=10.1038/417063a}}</ref> També s'ha proposat el nou fílum dels [[korarqueot]]s, que conté un nombre reduït d'inusuals espècies termòfiles que comparteixen trets dels dos fílums principals, però que són més properes als crenarqueots.<ref>{{ref-publicació |autor=Barns SM, Delwiche CF, Palmer JD, Pace NR |article=Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences |publicació=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volum=93 |exemplar=17 |pàgines=9188–93 |any=1996 |pmid=8799176 |url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=8799176 |doi=10.1073/pnas.93.17.9188}}</ref><ref>{{ref-publicació |autor=Elkins JG, Podar M, Graham DE, ''et al''. |article=A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea |publicació=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volum=105 |exemplar=23 |pàgines=8102–7 |any=2008 |mes=Juny |pmid=18535141 |doi=10.1073/pnas.0801980105 |url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=18535141}}</ref> Altres espècies d'arqueobacteris recentment descobertes només tenen una relació distant amb qualsevol d'aquests grups, com ara els [[ARMAN|nanoorganismes arquobacterians acidòfils de Richmond Mine]] (ARMAN), que foren descoberts el 2006.<ref>{{ref-publicació |autor=Baker, B.J., Tyson, G.W., Webb, R.I., Flanagan, J., Hugenholtz, P. and Banfield, J.F. |article=Lineages of acidophilic Archaea revealed by community genomic analysis. Science |publicació=Science |volum=314 |exemplar=6884 |pàgines=1933 – 1935 |any=2006 |doi=10.1126/science.1132690 |pmid=17185602}}</ref>