Afanobionts: diferència entre les revisions

Contingut suprimit Contingut afegit
m Leptictidium ha mogut Aphanobionta a Afanobionts: Títol en plural
mCap resum de modificació
Línia 4:
| categoria_subdivisio = [[Regne (biologia)|Regnes]] i Grups
| subdivisio =
* '''[[Virus|Acel·lulars virals]]''' <ref name="baltimore">{{ref-publicació|autor=Baltimore, D.|títol=The strategy of RNA viruses|publicació=Harvey Lect.|volum=70 Series|pàgines=57–74|any=1974|pmid=4377923}}</ref><ref> [https://www.clasificacionde.org/clasificacion-de-baltimore/ Clasificación de Baltimore] </ref>
** [[Riboviria]] ([[VirusAcel·lulars ARN]]) <ref name="ictv"/>
*** [[Viroide]]
*** Grup III: [[Virus ARN bicatenari]]
*** Grup IV: [[Virus ARN monocatenari positiv]]
*** Grup V: [[Virus ARN monocatenari negativ]]
** [[Desoviria]]* [[Virus ADNsatèl·lit ARN]] <ref name="ictv"/>
**** [[Virusoide]]
** [[Deoxyviria]] (Acel·lulars ADN)<ref name="ictv"/>
*** Grup I: [[Virus ADN bicatenari]]
*** Grup II: [[Virus ADN monocatenari]]
*** [[IncertaeVirus sedissatèl·lit ADN]]
**** [[Viròfag]]
** [[Ortervirales]]
*** Grup VI: [[Virus ARN monocatenari retrotranscrit]]
*** Grup VII: [[Virus ADN bicatenari retrotranscrit]]
* Acel·lulars prebiòtics
** '''Altres''' ([[Agents subvirals]])<ref> Royuela, Enrique. [http://feelsynapsis.com/jof/005/index.html?pageNumber=100 «Tabla periódica de los virus y sus partículas infecciosas.»] ''Journal of Feelsynapsis (JoF)''. {{ISSN|2254-3651}}. 2012.(5): 100-101.</ref>
** [[Protobiont]] †
*** [[Virió]] (Virus morfològicament complet)
** [[Hipòtesi del món d'ARN|Molècules autoreplicants de el món d'ARN]] †
*** [[Viroide]]
*** [[Virusoide]]
*** [[Prió]]<ref>[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/fs_prion.htm "90. Prions - ICTVdB Index of Viruses."] (Website.) U.S. National Institutes of Health website. </ref>
*** [[Viròfag]]
*** [[Bacteriòfag]]
*** [[Virus satèl·lit]]
*** [[Virus interferent defectuós]]
}}
 
'''Aphanobionta''' o també '''Acytota''' és un [[domini]] de [[vida]] proposat que descriu als [[virus]] i els agents subvirals en les classificacions biològiques.
 
Actualment s'estan construint i debatent la [[classificació dels virus]], s'han fet classificacions on se'ls agrupa depenent del tipus [[ADN]] o [[ARN]] que portin i el tipus de [[reproducció]], al seu torn dins els virus existeixen diversos agents subvirals com els [[virions]] o virus veritables, [[viroide]]s, [[Prió|prions]],i [[virus satèl·lit]]s, [[virofacs]], etc.
 
Els virus, juntament amb els agents virals, són classificats pel [[Comitè Internacional de Taxonomia de Virus]].<ref name="ictv">{{ref-web|títol=Virus Taxonomy: 2018 Release |url=https://talk.ictvonline.org/taxonomy/ |website=International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) |consulta= 13 octubre 2019 |llengua=en |format=html |data=octubre 2018}}</ref>
 
També es vaig crear que diversos dels seus grups no esten estretament emparentats com es pensa i que només tenen com a característica la manca de [[Cèl·lula|cèl·lules]] condició [[Plesiomorfia|plesiomórfica]] el que indicaria que són un [[tàxon]] [[parafilètic]].<ref> [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4836480/ Horizontal transfer - imperative mission of acellular life forms]</ref> Els primers acel·lulars van aparèixer durant el [[Hadeà]] fa 4400 milions d'anys època en què van sorgir les primeres [[Biomolècula|biomolècules orgàniques]]. (Veure [[Hipòtesi del món d'ARN]], [[Hipòtesi del món d'HAP]] i [[Teoria del món de ferro-sulfur]]). Es vaig crear que d'alguns organismes acel·lulars antics han evolucionat els organismes cel·lulars ([[Cytota]]).<ref> Boenigk, J., Wodniok, S., & Glücksman, E. (2015). ''Biodiversity and Earth history''. Springer.</ref>
 
== Tipus de acel·lulars o entitats víriques ==
[[File:SARS-CoV-2_without_background.png|thumb|200px|Virió ''[[Coronavirus]]''.]]
[[File:Sputnik_virofago.jpg|thumb|200px|Viròfag ''[[Sputnikvirus]]''.]]
[[File:Estructura de un pospiviroid.pdf|thumb|200px|Dibuix d'un viroide de la família ''[[Pospiviroidae]]''.]]
 
Els acel·lulars es classifiquen depenent el tipus de material genètic que portin, però presenten diverses composicions genòmiques o biomoleculars:<ref>[https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/subviral-agent Agents subvirals Sciencedirect]</ref>
 
*'''[[Virió|Virió o virus veritable]]''': Compostos per material genètic pot ser [[ADN]] o [[ARN]], un [[càpside]] proteica i un embolcall lipídica. S'especialitzen en infectar qualsevol tipus d'organisme com els [[bacteriòfag]]s en [[bacteria]]s.
*'''[[Viroide]]''': estan compostos únicament per molècules d'ARN, no posseeixen càpside proteica i embolcall lipídica. Infecten exclusivament [[planta]]s.
*'''[[Virus satèl·lit]]''': Comparteixen les mateixes característiques que els virions o viroides, però es diferencien d'aquests en què són més petits i necessiten un virus auxiliar (virió) per a la infecció. Per tant es consideren virus dependents d'altres virus. Dins dels virus satèl·lit es poden distingir alguns subtipus:
**'''[[Viròfag]]''': Són virus satèl·lits d'ADN que infecten a altres virus.
**'''[[Virusoide]]''': Són virus satèl·lits d'ARN similar als viroides, però que necessiten un virus auxiliar per a la seva replicació.
 
Actualment s'han descrit més de 4853 espècies de acel·lulars,<ref>[https://talk.ictvonline.org/files/ictv_documents/m/newsletters/7970/download 2018 ICTV Newsletter #15, September 2018] International Committee on Taxonomy of Viruses. Consultado el 26 de septiembre de 2018.</ref> però es vaig crear que poden haver milions d'espècies que encara no han estat halladas.<ref>{{cite journal | vauthors = Dávila-Ramos S, Castelán-Sánchez HG, Martínez-Ávila L, Sánchez-Carbente MD, Peralta R, Hernández-Mendoza A, Dobson AD, Gonzalez RA, Pastor N, Batista-García RA | display-authors = 6 | title = A Review on Viral Metagenomics in Extreme Environments | journal = Frontiers in Microbiology | volume = 10 | issue = | pages = 2403 | date = 2019 | pmid = 31749771 | pmc = 6842933 | doi = 10.3389/fmicb.2019.02403 }}</ref> La major part de la diversitat acel·lular s'ha descrit exclusivament en els [[eucariotes]], però falta per descriure més acel·lulars en els [[procariotes]].
 
== Filogènia ==
 
Estudis dels plecs de les [[proteïnes]] virals i els [[Proteoma|proteomes]] de diverses famílies virals i diversos talls cel·lulars van mostrar que els acel·lulars són un tàxon complexament parafilético. L'anàlisi va demostrar que els [[virus d'ARN]] van formar un grup parafilètic dels [[virus d'ADN]] com bé s'havia suggerit anteriorment, però els organismes cel·lulars (Cytota) van sorgir dins els virus d'ADN sent la família Mimiviridae la més propera a aquests. L'anàlisi també va revelar que molts grups de la [[classificació de Baltimore]] i alguns ordres establerts pel ICTV són de fet polifiléticos. Els virus retrotranscritos i els virus gegants no van formar grups monofilètics el que implica que van evolucionar independentment en diferents línies evolutives. Generalment es considera que els virus no van ser ancestres dels organismes cel·lulars perquè no tenen moltes característiques presents en els organismes cel·lulars com [[Ribosoma|ribosomes]], [[Citoplasma|citoplasmes]], [[membrana plasmàtica]], etc, el que dóna a entendre que els virus van aparèixer diverses vegades en la terra primitiva abans de l'aparició dels organismes cel·lulars. Els viroides i virusoide no van formar part de l'anàlisi. La filogènia va ser la següent:<ref name="nasir">{{cite journal |last1=Arshan |first1=Nasir |last2=Caetano-Anollés |first2=Gustavo |date=25 September 2015 |title=A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution |journal=[[Science Advances]] |volume=1 |number=8 |page=e1500527 |doi=10.1126/sciadv.1500527 |pmid=26601271 |pmc=4643759 |bibcode=2015SciA....1E0527N }}</ref><ref name="diana">{{cite press release |last=Yates |first=Diana |date=25 September 2015 |title=Study adds to evidence that viruses are alive |url=https://news.illinois.edu/blog/view/6367/250879 |location=Champaign, IL |publisher=University of Illinois at Urbana–Champaign |accessdate=2015-10-20 |url-status=live |archiveurl=https://web.archive.org/web/20151119153226/https://news.illinois.edu/blog/view/6367/250879 |archivedate=19 November 2015 |df=dmy-all }}</ref><ref name="bmc"> [https://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2148-12-156 Giant viruses coexisted with the cellular ancestors and represent a distinct supergroup along with superkingdoms Archaea, Bacteria and Eukarya] BMC</ref><ref name="frontiers">[https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2014.00194/full The distribution and impact of viral lineages in domains of life]. Frontiers. </ref>
 
{{Clade | style=font-size:100%;line-height:100%
Els virus, juntament amb prions i altres agents virals, són classificats pel [[Comitè Internacional de Taxonomia de Virus]].<ref name="ictv">{{ref-web|títol=Virus Taxonomy: 2018 Release |url=https://talk.ictvonline.org/taxonomy/ |website=International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) |consulta= 13 octubre 2019 |llengua=en |format=html |data=octubre 2018}}</ref>
| label1='''Acytota'''
| 1={{clade
|1=[[Leviviridae]]
|2={{clade
|1=[[Partitiviridae]]
|2={{clade
|1=[[Chrysoviridae]]
|2={{clade
|1=[[Barnaviridae]]
|2={{clade
|1={{clade
|1=[[Marnaviridae]]
|2={{clade
|1=[[Tombusviridae]]
|2={{clade
|1=[[Tymoviridae]]
|2={{clade
|1=[[Roniviridae]]
|2={{clade
|1=[[Narnaviridae]]
|2={{clade
|1=[[Luteoviridae]]
|2=[[Hepadnaviridae]] }} }} }} }} }} }}
|2={{clade
|1=[[Caulimoviridae]]
|2={{clade
|2= ——> > > >
|1={{clade
|1=[[Alphatetraviridae]]
|2={{clade
|1=[[Birnaviridae]]
|2=[[Endornaviridae]] }} }}}} }} }} }} }} }} }} }}
{{Clade | style=font-size:100%;line-height:100%
|1={{clade
|1={{clade
|1={{clade
|1={{clade
|1=[[Retroviridae]]
|2=[[Metaviridae]] }}
|2={{clade
|1=[[Reoviridae]]
|2={{clade
|1=[[Plasmaviridae]]
|2={{clade
|1=[[Orthomyxoviridae]]
|2={{clade
|2=[[Paramyxoviridae]]
|1={{clade
|1=[[Polydnaviridae]]
|2=[[Astroviridae]] }} }} }} }}
|2={{clade
|1={{clade
|1=[[Betaflexiviridae]]
|2=[[Closteroviridae]] }}
|2={{clade
|1={{clade
|1=[[Togaviridae]]
|2={{clade
|1=[[Flaviviridae]]
|2={{clade
|1=[[Corticoviridae]]
|2=[[Coronaviridae]] }} }} }}
|2={{clade
|1=[[Potyviridae]]
|2=[[Caliciviridae]] }} }} }} }} }}
|2={{clade
|1=[[Hepeviridae]]
|2={{clade
|1=[[Filoviridae]]
|2={{clade
|1=[[Cystoviridae]]
|2={{clade
|1=[[Bromoviridae]]
|2={{clade
|1=[[Arenaviridae]]
|2=[[Virgaviridae]] }} }} }} }} }} }}
|2={{clade
|1=[[Hypoviridae]]
|2={{clade
|1={{clade
|1={{clade
|1=[[Lipothrixviridae]]
|2=[[Rudiviridae]] }}
|2={{clade
|1={{clade
|1=[[Lavidaviridae]]
|2={{clade
|1=[[Fuselloviridae]]
|2=[[Globuloviridae]] }} }}
|2={{clade
|1=[[Polyomaviridae]]
|2={{clade
|1=[[Papillomaviridae]]
|2={{clade
|1=[[Circoviridae]]
|2=[[Parvoviridae]] }} }} }} }} }}
 
| 2={{clade
També es vaig crear que diversos dels seus grups no esten estretament emparentats com es pensa i que només tenen com a característica la manca de [[Cèl·lula|cèl·lules]] condició [[Plesiomorfia|plesiomórfica]] el que indicaria que són un [[tàxon]] [[parafilètic]].<ref> [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4836480/ Horizontal transfer - imperative mission of acellular life forms]</ref> Els primers acel·lulars van aparèixer durant el [[Hadeà]] fa 4300 milions d'anys època en què van sorgir les primeres [[Biomolècula|biomolècules orgàniques]]. (Veure [[Hipòtesi del món d'ARN]], [[Hipòtesi del món d'HAP]] i [[Teoria del món de ferro-sulfur]]). Es vaig crear que d'alguns organismes acel·lulars antics han evolucionat els organismes cel·lulars ([[Cytota]]).<ref> Boenigk, J., Wodniok, S., & Glücksman, E. (2015). ''Biodiversity and Earth history''. Springer.</ref>
|1=[[Geminiviridae]]
|2={{clade
|1={{clade
|1=[[Adenoviridae]]
|2=[[Siphoviridae]] }}
|2={{clade
|1=[[Bicaudaviridae]]
|2={{clade
|1={{clade
|1=[[Herpesviridae]]
|2=[[Nimaviridae]] }}
|2={{clade
|1={{clade
|1=[[Baculoviridae]]
|2=[[Myoviridae]] }}
|2={{clade
|1=[[Tectiviridae]]
|2={{clade
|1=[[Poxviridae]]
|2={{clade
|1=[[Iridoviridae]]
|2={{clade
|1=[[Phycodnaviridae]]
|2=[[Mimivirus|Mimiviridae]] }} }} }} }}}} }} }} }} }} }} }} }} }}
 
== Referències ==