La Comissaria General de Recursos Operatius s'estructura en els òrgans següents:<ref>[http://www.gencat.cat/mossos/cme/organitzacio/documentacio/organigrama.pdf Organigrama de la Policia de la Generalitat - Mossos d'Esquadra]</ref>
a)* '''[[Divisió d'Intervenció]]''': dirigeix les àrees d'intervenció especialment entrenades per actuar en situacions excepcionals.<ref>Articles 177, 178, 179 i 180 del [https://www.gencat.cat/eadop/imatges/5005/07303094.pdf Decret 243/2007 d'estructura del Departament d'Interior, Relacions Institucionals i Participació]</ref>
b)* '''[[Divisió de Suport Operatiu]]''': dirigeix aquelles àrees que proporcionen a la resta d'àrees del cos recursos humans especialitzats.<ref>Articles 181, 182, 183, 184 i 185 del [https://www.gencat.cat/eadop/imatges/5005/07303094.pdf Decret 243/2007 d'estructura del Departament d'Interior, Relacions Institucionals i Participació]</ref>
c)* '''[[Àrea Tècnica de Planificació i Dispositius]]''' (ATPD): organitza grans dispositius especials que requereixen gran nombre d'efectius, assessora la resta del cos del suport que els pot ogerir la CGRO i fa informes sobre la seguretat dels edificis que s'han de protegir.
d)* '''[[Àrea d'Escortes]]''' (AE): assumeix la protecció dels representants de la democràcia catalana, els membres més rellevants de les seves institucions i de les altres persones que se'ls encomani.
e)* '''Oficina de Suport''' de la Comissaria General: assessora el cap de la CGIC i gestiona operativament els seus recursos humans i materials.
