Mètode proteic

Els mètodes proteics són les tècniques que s'utilitzen per a estudiar proteïnes.

Llista de mètodes proteics

Hi ha mètodes genètics per a estudiar proteïnes, mètodes per a detectar-ne, mètodes per a aïllar-ne i purificar-ne, i altres mètodes per a determinar-ne l'estructura i el funcionament, que sovint requereixen una purificació prèvia de les proteïnes.

Mètodes genètics

• traducció conceptual: moltes proteïnes no són mai seqüenciades directament, però es coneix la seva seqüència d'aminoàcids per la "traducció conceptrual" d'una seqüència coneguda d'ARNm. Vegeu codi genètic.
• la mutagènesi dirigida permet produir noves variants de proteïnes i analitzar com els canvis estructurals alteren el funcionament de les proteïnes.
  • la inserció d'etiquetes proteiques com ara les etiquetes de polihistidina. Vegeu també proteïna de fluorescència verda.
• evolutiu; anàlisi de canvis seqüencials en diferents espècies mitjançant programari com ara BLAST.
• es poden identificar les proteïnes implicades en les malalties humanes relacionant al·lels amb malalties i altres fenotips, utilitzant mètodes com ara el càlcul de la puntuació L0D.

Detecció de proteïnes

• microscòpia, immunotinció de proteïnes
• immunoprecipitació, Immunoprecipitació de proteïnes
• Transferència Western
• Espectrofotometria
• Assaig enzimàtic

Purificació de proteïnes

• Aïllament de proteïnes
  • Mètodes de cromatografia
• Extracció i solubilització de proteïnes
• Mètodes de determinació de la concentració de proteïnes, mètode de Bradford
• Solucions de proteïna concentrada
• Electrofòresi amb gel
  • Electrofòresi amb gel en condicions desnaturalitzants
  • Electrofòresi amb gel en condicions no desnaturalitzants
  • Electrofòresi amb gel en 2D
• Electroenfocament

Estructura de les proteïnes

• Difracció de raigs X
• Espectroscopia mitjançant ressonància magnètica nuclear de proteïnes

Interaccions proteïna-ADN

• Chip on chip
• Seqüenciació de xips

Altres mètodes

• Intercanvi hidrogen-deuteri
• Espectrometria de masses
• Dinàmica molecular
• Predicció d'estructura de proteïnes
• Seqüenciació de proteïnes
• Alineament estructural
• Ontologia de les proteïnes
• Petja peptídica
• Tècnica d'unió a lligand
• etiquetatge metabòlic
  • etiquetatge amb isòtops pesants
  • etiquetatge amb isòtops radioactius