Obre el menú principal

The All-Species Living Tree

El projecte 'The All-Species Living Tree' Project és una col·laboració entre diversos grups/instituts acadèmics, com ARB, SILVA i LPSN, amb la finalitat de realitzar una base de dades de seqüències d'ARNr 16S de totes les espècies conegudes d'eubacteris i arqueobacteris.[1] Inicialment també es recol·lectaven les seqüències 23S,[2] però es va deixar de fer. Actualment hi ha més d'11.000 espècies alineades i diverses més estan sent afegides així que noves espècies van sent descobertes, cultivades i seqüenciades.

ArbreModifica

L'arbre va ser creat per ML sense bootstrap: conseqüentment la interrelació entre diversos fílums no està realment clara (com és el cas dels firmicuts). Els eucariotes no estan representats en l'anàlisi.

Domain Archaea

Crenarchaeota (Thermoprotei)


 Euryarchaeota

Methanopyrus



Eurythermea

Thermoplasmatales



Thermococcaceae



Neobacteria


Archaeoglobaceae



Methanococcales





Methanobacteriales




Methanomicrobia



Halobacteriaceae








Domain Eubacteria

Thermotogales




Thermodesulfobiaceae (Firmicutes)




Synergistaceae {Clostridiale Família XV Incertae Sedis} (Firmicutes)





Dictyoglomus



Thermoanaerobacterales subclade I (Firmicutes)





Thermoanaerobacteraceae (Firmicutes)



Plantilla:Clade







ReferènciesModifica

  1. Yarza, P.; Richter, M.; Peplies, J. R.; Euzeby, J.; Amann, R. «The All-Species Living Tree project: A 16S rRNA-based phylogenetic tree of all sequenced type strains». Systematic and Applied Microbiology, 31, 4, 2008, pàg. 241–250. DOI: 10.1016/j.syapm.2008.07.001. PMID: 18692976.
  2. Yarza, Pablo; Ludwig, Wolfgang; Euzéby, Jean; Amann, Rudolf; Schleifer, Karl-Heinz «Update of the All-Species Living Tree Project based on 16S and 23S rRNA sequence analyses». Systematic and Applied Microbiology, 33, 6, 2010, pàg. 291–299. DOI: 10.1016/j.syapm.2010.08.001. PMID: 20817437.

Enllaços externsModifica