BRENDA
BRENDA (acrònim de BRaunschweig ENzyme DAtabase) és una de les bases de dades més àmplies amb informació molecular i bioquímica sobre enzims i rutes metabòliques.[1][2] Inclou informació sobre la classificació i nomenclatura, reacció i especificitat, paràmetres funcionals, aparició, estructura i estabilitat de l'enzim, mutants i enginyeria enzimàtica, preparació i aïllament, aplicació d'enzims i dades relacionades amb lligands.[3]
| URL | http://www.brenda-enzymes.org/ i https://www.brenda-enzymes.org/index.php  |
|---|---|
| Tipus | base de dades biològica i ELIXIR Core Data Resource (en)  |
| Llicència | llicència de propietat i CC BY 4.0 |
| Part de | ELIXIR Germany |
| Creador | Dietmar Schomburg |
| Llançament | 1987 |
Va ser fundada l'any 1987 pel Centre Nacional de Biotecnologia Alemany (GBF) a Brunsvic, al que actualment és el Centre Helmholtz d'Investigació sobre Infeccions (HZI). Llavors va ser administrada per l'Institut de Bioquímica de la Universitat de Colònia fins al 2007, mentre que en l'actualitat està en mans del Departament de Bioquímica i Bioinformàtica de la Universitat Tècnica de Brunsvic. Les seves dades estan disponibles en línia des de 1998,[4] després d'haver-les publicat en llibres des de la seva fundació.[5]
Referències modifica
- ↑ von der Lieth, Claus-Wilhelm; Luetteke, Thomas; Frank, Martin. Bioinformatics for Glycobiology and Glycomics: An Introduction. John Wiley & Sons, 2009, p. 494. ISBN 978-0-470-0296-02.
- ↑ Aehle, Wolfgang; Eck, Juergen. «Discovery of Enzymes». A: Enzyme Catalysis in Organic Synthesis: A Comprehensive Handbook. John Wiley & Sons, 2012, p. 1985. ISBN 978-3-527-32547-4.
- ↑ Chang, A.; Scheer, M.; Grote, A.; Schomburg, I.; Schomburg, D. «BRENDA, AMENDA and FRENDA the enzyme information system: new content and tools in 2009». Nucleic Acids Research, 37, supl. 1, 2008, pàg. D588-D592. DOI: 10.1093/nar/gkn820. PMC: 2686525. PMID: 18984617.
- ↑ Schomburg, I.; Chang, A.; Placzek, S.; Söhngen, C.; Rother, M. «BRENDA in 2013: integrated reactions, kinetic data, enzyme function data, improved disease classification: new options and contents in BRENDA». Nucleic Acids Research, 41, pàg. D764-D772.
- ↑ Scheer, M.; Grote, A.; Chang, A.; Schomburg, I.; Munaretto, C. «BRENDA, the enzyme information system in 2011» (PDF). Nucleic Acids Research, 39, 2011, pàg. 670-676.