Gene Ontology: diferència entre les revisions
Contingut suprimit Contingut afegit
més teca |
exemple |
||
Línia 3:
El '''Gene Ontology''' és una projecte de l'àmbit de la [[bioinformàtica]] que té com a objectiu la descripció estructurada de [[gen|gens]] i llurs [[producte gènic|productes gènics]] mitjançant un conjunt de diferents [[Ontologia (tecnologia de la informació)|ontologies]] [[Biologia|biològiques]] curades manualment.
Actualment consta de tres ontologies, o [[espai de noms|espais de noms]], diferenciades que poden representar-se com a [[Graf acíclic dirigit|grafs acíclics
* [[Cèl·lula|Component cel·lular]], com ara el [[reticle endoplasmàtic]].
* [[Funció molecular]], com ara [[quinasa]].
* [[Procés biològic]], com ara el [[cicle de Krebs]].
== Exemple de terme GO ==
<pre>
id: GO:0000016
name: lactase activity
namespace: molecular_function
def: "Catalysis of the reaction: lactose + H2O = D-glucose + D-galactose." [EC:3.2.1.108]
synonym: "lactase-phlorizin hydrolase activity" BROAD [EC:3.2.1.108]
synonym: "lactose galactohydrolase activity" EXACT [EC:3.2.1.108]
xref: EC:3.2.1.108
xref: MetaCyc:LACTASE-RXN
xref: Reactome:REACT_100439 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Gallus gallus"
xref: Reactome:REACT_104113 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Rattus norvegicus"
xref: Reactome:REACT_105850 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Bos taurus"
xref: Reactome:REACT_109208 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Taeniopygia guttata"
xref: Reactome:REACT_109391 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Sus scrofa"
xref: Reactome:REACT_109447 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Danio rerio"
xref: Reactome:REACT_112431 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Caenorhabditis elegans"
xref: Reactome:REACT_114967 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Drosophila melanogaster"
xref: Reactome:REACT_30821 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Mus musculus"
xref: Reactome:REACT_78084 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Canis familiaris"
xref: Reactome:REACT_78754 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Xenopus tropicalis"
xref: Reactome:REACT_9455 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Homo sapiens"
xref: RHEA:10079
is_a: GO:0004553 ! hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds
</pre>
Font:<ref>{{cite web
| url = http://www.geneontology.org/ontology/obo_format_1_2/gene_ontology.1_2.obo
| title = gene_ontology.1_2.obo
| accessdate = 2015-03-15
| author = The GO Consortium
| date = 2015-03-15
| format = OBO 1.2 flat file
}}</ref>
== Enllaços externs ==
* [http://geneontology.org/ Gene Ontology]
== Referències ==
[[Categoria:Bioinformàtica]]
| |||