ConstruïdaTot i que l'església de Sant Joan Baptista de Perpinyà està documentada des del [[927]]<ref>Puig 2008.</ref>, el temple actual es construí entre [[1324]] i [[1509]], al costat d'unade l'església anterior dedicada a Sant Joan, la de [[Sant Joan Vell de Perpinyà|Sant Joan Vell]], que data dels segles XII-XIII (consagrada el [[1246]]), que es conservaconservada al costat nord de la catedral actual. L'església, seu de la parròquia antiga de Perpinyà, creada el 1025, va esdevenir seu d'una comunitat de canonges agustinians el [[1102]].
Des del [[1230]], va ser unida a la seu episcopal d'[[Elna]]. El 1324, quan la ciutat va ser capital del [[Regne de Mallorca]], el rei [[Sanç I de Mallorca|Sanç]] començà a bastir el nou edifici amb la intenció de convertir-lo en la futura seu de la diòcesi.
