Su superficie está plagada de [[Cráter de impacto|cráteres]], algunos de ellos de un tamaño gigantesco comparado con el tamaño de la luna: Pan, el cráter más extenso, mide 100{{esd}} km de diámetro y tiene 8 kilómetros de profundidad.<ref name="Thomas"/> El segundo cráter en extensión, Gaea, tiene un diámetro de 80 kilómetros, y es probablemente el doble de profundo que Pan.<ref name="Thomas"/> Amaltea también se caracteriza por sus altas y numerosas montañas, dos de ellas, Mons Lyctas y Mons Ida, alcanzan los 20 kilómetros de altura.<ref name="Thomas">{{ref-publicació|nom=P. C. |cognom=Thomas |any=1998 |article=The Small Inner Satellites of Jupiter |publicació=Icarus |volum=135 |pàgina=360-371 |llengua=anglès}}</ref>
