En l'any 3000X300X la Terra cau sota el domini del malvat emperador Bola de Billar IV.I per a afermar el seu poder decideix crear un exèrcit de Caçadors de Pèl, que es dediquen a rapar a la gent de tot el món. Bobobo, que des de menut va tenir l'especial habilitat de comunicar-se amb el pèl de la gent i fins i tot amb el seu propi, es veu espentat a lluitar contra Bola de Billar IV i pren el pseudònim de "El lliberta-cabelleres". Amb l'ajuda de cada vegada més personatges igual de estrafalaris que ell, anirà derrotant a les diferents divisions de l'exèrcit del malvat emperador, fins a crear un món en el qual el pèl de la gent puga ser lliure.
