Després de la [[Exposició Universal de 1888]], més concretament el [[18 de gener]] de [[1890]], es va crear una ''Comissió Municipal de Conservació dels edificis del Parc i del Foment dels Museus Municipals''. Aquesta comissió va ser la responsable de la creació del museu.
El museu es va inaugurar el [[1891]] durant l'últim mandat de [[Francesc de Paula Rius i Taulet|Rius i Taulet]] com a alcalde de Barcelona. El [[1896]] la col·lecció es va ubicar al [[Palau de la Indústria]], del mateix [[Parc de la Ciutadella]], per tornar a l'edifici inicial el [[1898]]. El [[1907]] es repeteix aquest trasllat.
Quan, el [[1934]], es va inaugurar el [[Museu d'Art de Catalunya]], les obres es van traslladar al [[Palau Nacional de Montjuïc]], però quan va esclatar la [[guerra civil espanyola]] la col·lecció fou traslladada a [[Olot]] i [[Darnius]].<ref name="sastre">Andrea A. Garcia i Sastre: ''Els Museus d'Art de Barcelona: Antecedents, gènesi i desenvolupament fins l'any 1915''. Publicacions l'Abadia de Montserrat</ref>
El [[1945]], al tornar la col·lecció a Barcelona, ja no es va dur al Palau Nacional sinó que es va instal·lar al Palau de la Ciutadella i es va inaugurar un nou museu, que seria conegut amb el nom de [[Museu d'Art Modern de Barcelona|Museu d'Art Modern]]. Anys més tard aquest museu també seria integrat en un altre, aquest cop el [[MNAC]].
