Interactòmica

La Interactòmica la ciència que estudia l'interactoma, tot el conjunt d'interaccions entre molècules dins la cèl·lula. Dins de la proteòmica, es refereix a les interaccions proteïna-proteïna.

Mètodes per completar l'interactomaModifica

Els mètodes experimentals que s'han dissenyat per a estudiar l'interactoma són 1) afinitat per purificació, serveix per identificar complexos de proteïnes i 2) doble híbrids de llevat (yeast two hybrid (Y2H), s'utilitza per identificar massivament interacciones entre proteïnes.

Existeix un gran esforç per a escriure un mapa de l'interactoma d'éssers eucariotes. S'han creat des del 2006 Llevat, mosca, nematodes i humà.

Bases de dades d'interactomesModifica

Vegeu tambéModifica

Enllaços externsModifica

ReferènciesModifica

  • Bader GD, et al. (2003) BIND: The Biomolecular interaction Network Database. Nucleic Acids Res., 31, 248-50.
  • Brown KR, Jurisica I. (2005) Online Predicted Human Interaction Database. Bioinformatics, 21(9): 2076-82.
  • Xenarios I, Rice DW, Salwinski L, Baron MK, Marcotte EM, Eisenberg D. (2000) DIP: the database of interacting proteins. Nucleic Acids Res. 28: 289-91.
  • Peri S., Navarro JD, Amanchy R, Kristiansen TZ, Jonnalagadda CK, et al. (2003) Development of human protein reference database as an initial platform for approaching systems biology in humans. Genome Res 13:2363-71.
  • Park J, Lappe M, Teichmann SA. (2001) Mapping protein family interactions: intramolecular and intermolecular protein family interaction repertoires in the PDB and yeast. J Mol Biol. 2001 Mar 30;307(3):929-38.