Mouse Genome Informatics
Mouse Genome Informatics (MGI) és una base de dades en línia gratuïta i un recurs de bioinformàtica allotjat en el The Jackson Laboratory, amb finançament del National Human Genome Research Institute (NHGRI o Institut Nacional d'Investigació del Genoma Humà), l'National Cancer Institute (NCI o Institut Nacional del Càncer) i l'Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD, o Institut Nacional de Salut Infantil i Desenvolupament Humà Eunice Kennedy Shriver).[1] MGI proporciona accés a les dades sobre la genètica, la genòmica i la biologia del ratolí de laboratori per facilitar l'estudi de la salut humana i la malaltia.[2][3] La base de dades integra múltiples projectes, amb les dues contribucions més importants procedents de la Mouse Genome Database (Base de dades del genoma del ratolí) i de la Mouse Gene Expression Database (GXD o Base de dades de l'Expressió Gènica del Ratolí).[4] A partir de 2018, MGI conté dades seleccionades a partir de més de 230.000 publicacions.[5]
El recurs MGI es va publicar per primera vegada en línia l'any 1994[5] i és una col·lecció de dades, eines i anàlisis creades i adaptades per al seu ús en el ratolí de laboratori, un organisme model molt utilitzat. És "la font autoritzada de noms oficials per a gens, al·lels i soques de ratolí", que segueix les directrius establertes pel International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Mice (Comitè Internacional de Nomenclatura Genètica Estandaritzada per a Ratolins).[6] La història i l'enfocament de les instal·lacions de producció i recerca del Laboratori Jackson genera un gran i profund coneixement que els investigadors poden extreure per avançar en la seva investigació, i és una eina indispensable per a qualsevol investigador que utilitzi el ratolí com a organisme model per a la seva investigació, i per als investigadors interessats en gens que comparteixen homologia amb els gens del ratolí. Diversos recursos de suport a la recerca de ratolins, com ara col·leccions d'animals i programari gratuït de gestió de colònies, també estan disponibles al lloc MGI.[7]
Referències
modifica- ↑ «MGI-MGI Current Funding Support». jax.org. [Consulta: 2 juny 2015].
- ↑ Shaw D «Searching the Mouse Genome Informatics (MGI) resources for information on mouse biology from genotype to phenotype». Current Protocols in Bioinformatics, vol. Chapter 1, May 2004, pàg. Unit 1.7. DOI: 10.1002/0471250953.bi0107s05. PMC: 5147750. PMID: 18428715.
- ↑ (8–11 August 2005) "Data integration in the mouse genome informatics (MGI) database" a Computational Systems Bioinformatics Conference, 2005. Workshops and Poster Abstracts. IEEE. : 37–8. DOI:10.1109/CSBW.2005.48
- ↑ «MGI-About the Mouse Genome Informatics database resource». jax.org. [Consulta: 2 juny 2015].
- ↑ 5,0 5,1 Law, M; Shaw, DR. Mouse Genome Informatics (MGI) Is the International Resource for Information on the Laboratory Mouse.. 1757, 2018, p. 141–161 (Methods in Molecular Biology). DOI 10.1007/978-1-4939-7737-6_7. ISBN 978-1-4939-7736-9.
- ↑ Mouse Nomenclature Home Page, <http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/>. Consulta: 28 agost 2016
- ↑ Ivica Letunic. «OpenHelix: Mouse Genome Informatics (MGI)». openhelix.com. Arxivat de l'original el 26 December 2017. [Consulta: 2 juny 2015].