ARN bacterià petit
El ARN bacterià petit (em anglès:Bacterial small RNAs (sRNA)) són ARN no codificants de pocs nucleòtids (de 50 a 250) que són produïts per bacteris. Estan altament estructurats i contenen diversos stem-loops.[1][2] S'han identificat nombrosos sRNAs en moltes espècies de bacteris incloent Escherichia coli, els alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti, el cianobacteri marí, Francisella tularensis (agent causant de la tularaemia) i el patogen de les plantes Xanthomonas oryzae pathovar oryzae.[3][4][5][6][7][8][9][10]
En la dècada de 1960, la forma abreujada sRNA es feia servir per a referir-se a "soluble RNA," el qual ara es coneix com a ARN de transferència o tRNA.[11])
Funció
modificaEls sRNAs es poden o bé enllaçar a proteïnes objectiu i modificar-ne la funcó o enllaçar-se a mRNA objectius i regular l'expressió gènica.[1][12]
Referències
modifica- ↑ 1,0 1,1 Vogel J, Wagner EG «Target identification of small noncoding RNAs in bacteria». Curr. Opin. Microbiol., 10, 3, juny 2007, pàg. 262–70. DOI: 10.1016/j.mib.2007.06.001. PMID: 17574901.
- ↑ Viegas SC, Arraiano CM «Regulating the regulators: How ribonucleases dictate the rules in the control of small non-coding RNAs». RNA Biol, 5, 4, 2008, pàg. 230–43. PMID: 18981732.
- ↑ Hershberg R, Altuvia S, Margalit H «A survey of small RNA-encoding genes in Escherichia coli». Nucleic Acids Res., 31, 7, abril 2003, pàg. 1813–20. DOI: 10.1093/nar/gkg297. PMC: 152812. PMID: 12654996.
- ↑ Wassarman KM, Repoila F, Rosenow C, Storz G, Gottesman S «Identification of novel small RNAs using comparative genomics and microarrays». Genes Dev., 15, 13, juliol 2001, pàg. 1637–51. DOI: 10.1101/gad.901001. PMC: 312727. PMID: 11445539.
- ↑ Argaman L, Hershberg R, Vogel J, et al. «Novel small RNA-encoding genes in the intergenic regions of Escherichia coli». Curr. Biol., 11, 12, juny 2001, pàg. 941-50. DOI: 10.1016/S0960-9822(01)00270-6. PMID: 11448770.
- ↑ Rivas E, Klein RJ, Jones TA, Eddy SR «Computational identification of noncoding RNAs in E. coli by comparative genomics». Curr. Biol., 11, 17, setembre 2001, pàg. 1369–73. DOI: 10.1016/S0960-9822(01)00401-8. PMID: 11553332.
- ↑ Schlüter JP, Reinkensmeier J, Daschkey S, et al. «A genome-wide survey of sRNAs in the symbiotic nitrogen-fixing alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti». BMC Genomics, 11, 2010, pàg. 245. DOI: 10.1186/1471-2164-11-245. PMC: 2873474. PMID: 20398411.
- ↑ Axmann IM, Kensche P, Vogel J, Kohl S, Herzel H, Hess WR «Identification of cyanobacterial non-coding RNAs by comparative genome analysis». Genome Biol., 6, 9, 2005, pàg. R73. DOI: 10.1186/gb-2005-6-9-r73. PMC: 1242208. PMID: 16168080.
- ↑ Postic G, Frapy E, Dupuis M, et al. «Identification of small RNAs in Francisella tularensis». BMC Genomics, 11, 2010, pàg. 625. DOI: 10.1186/1471-2164-11-625. PMC: 3091763. PMID: 21067590.
- ↑ Liang H, Zhao YT, Zhang JQ, Wang XJ, Fang RX, Jia YT «Identification and functional characterization of small non-coding RNAs in Xanthomonas oryzae pathovar oryzae». BMC Genomics, 12, 2011, pàg. 87. DOI: 10.1186/1471-2164-12-87. PMC: 3039613. PMID: 21276262.
- ↑ Crick F «Codon–anticodon pairing: the wobble hypothesis». J Mol Biol, 19, 2, 1966, pàg. 548–55. DOI: 10.1016/S0022-2836(66)80022-0. PMID: 5969078.
- ↑ Cao Y, Wu J, Liu Q, et al. «sRNATarBase: a comprehensive database of bacterial sRNA targets verified by experiments». RNA, 16, 11, novembre 2010, pàg. 2051–7. DOI: 10.1261/rna.2193110. PMID: 20843985.