El diagnòstic perdel rotavirus normalment és un diagnòstic de [[gastroenteritis]] com a causa de la diarrea greu. LaA la majoria dels nens ingressats en hospitals per gastroenteritis se'ls fa el test del rotavirus A.<ref name="pmid17901797">{{citar publicació|autor=Patel MM, Tate JE, Selvarangan R, ''et al.'' |títol=Routine laboratory testing data for surveillance of rotavirus hospitalizations to evaluate the impact of vaccination |publicació=Pediatr. Infect. Dis. J. |volum=26 |issue=10 |pàgines=914–9 |any=2007 |pmid=17901797 |doi=10.1097/INF.0b013e31812e52fd }}</ref><ref name="pmid16650331">{{citar publicació|autor=The Pediatric ROTavirus European CommitTee (PROTECT) |títol=The paediatric burden of rotavirus disease in Europe |publicació=Epidemiol. Infect. |volum=134 |issue=5 |pàgines=908–16 |any=2006 |pmid=16650331 |pmc=2870494 |doi=10.1017/S0950268806006091}}</ref> El diagnòstic específic per a infecció per rotavirus A es realitza buscant el virus en la femta dels nens a través d'un [[ELISA|immunoassaig]]. Hi ha diversos kitsequips de prova amb llicència en el mercat que són sensibles, específics i detectedetecten tots els serotips de rotavirus A.<ref name="isbn0-12-375147-0">{{cita llibre|autor=Angel J, Franco MA, Greenberg HB|editor=Mahy WJ and Van Regenmortel MHV |títol=Desk Encyclopedia of Human and Medical Virology|editorial=Academic Press |lloc=Boston |any=2009|pàgina=278|isbn=0-12-375147-0}}</ref> Altres mètodes, com la [[microscòpia electrònica]] i la [[Reacció en cadena de la polimerasa|PCR]], s'utilitzen en els laboratoris d'investigació.<ref name="isbn0-471-49663-4">{{cita llibre|autor=Goode, Jamie; Chadwick, Derek |títol=Gastroenteritis viruses |editor=Wiley |lloc=Nova York |any=2001 |pàgina=14 |isbn=0-471-49663-4}}</ref> La transcripció inversa-reacció en cadena de la polimerasa (RT-PCR) pot detectar i identificar totes les espècies i serotips de rotavirus humans.<ref name="pmid15027000">{{citar publicació |autor=Fischer TK, Gentsch JR |títol=Rotavirus typing methods and algorithms |publicació=Reviews in Medical Virology |volum=14 |issue=2 |pàgines=71–82 |any=2004 |pmid=15027000 |doi=10.1002/rmv.411}}</ref>
