L'any 1987, amb motiu del mil·lenari de Sant Just Desvern, l'[[Orfeó Enric Morera]] va estrenar la seva ''Cantata de Sant Just''.
El juny de [[2008]] fou guardonat amb el [[Premi Nacional de Literatura]] concedit per la [[Generalitat de Catalunya]] per la seva obra ''Casa de Misericòrdia'',<ref>{{citar ref-web|url=http://www.lamalla.cat/actualitat_cultural/literatura/article?id=202157 |títol=El poeta Joan Margarit, Premi Nacional de Literatura |editor=[[lamalla.cat]] |data=[[30 de juny]] del [[2008]]|llengua=català}}</ref> i l'octubre del mateix any, per aquest mateix poemari, amb el Premi Nacional de Poesia atorgat pel Ministeri de Cultura del Govern d'Espanya<ref>{{citar ref-web|url=http://www.3cat24.cat/noticia/319313/ociicultura/El-poeta-Joan-Margarit-guanya-el-Premi-Nacional-de-Poesia-per-Casa-de-misericordia |títol=El poeta Joan Margarit guanya el Premi Nacional de Poesia per "Casa de misericòrdia" |editor=[[3cat24.cat]] |data=[[7 d'octubre]] del [[2008]]|llengua=català}}</ref> El [[2010]] Margarit fou l'encarregat de fer el pregó de la [[festa major]] de [[Barcelona]]. En aquell pregó va parlar de les relacions entre [[Catalunya]] i [[Espanya]] tot exposant que havia arribat l'hora de "renunciar al tipus d’unió que fa segles va convenir a les dues parts" i respectar la independència catalana si finalment "volem que la nació esdevingui una Holanda, o una Dinamarca".<ref>{{citar ref-web|url=http://www.vilaweb.cat/media/continguts/000/015/162/162.pdf |títol=Pregó de Joan Margarit |data=[[23 de setembre]] de [[2010]]|llengua=català}} {{pdf}}</ref><ref>{{citar ref-web|url=http://www.btvnoticies.cat/2010/09/23/el-prego-de-joan-margarit-crida-a-revisar-les-relacions-amb-espanya/ |títol=El pregó de Joan Margarit crida a revisar les relacions amb Espanya |editor=[[Barcelona TV|BTV Notícies]] |data=[[23 de setembre]] de [[2010]]|llengua=català}}</ref> També fou l'encarregat d'inaugurar el curs acàdèmic [[2010]]-[[2011]] de la [[Universitat Pompeu Fabra]] (UPF).<ref>{{citar ref-web|url=http://www.upf.edu/enoticies/1011/0921.html |títol=Joan Margarit inaugura el curs acadèmic 2010-2011 |editor=[[Universitat Pompeu Fabra|UPF]] |data=[[27 de setembre]] de [[2010]]|llengua=català}}</ref>
