Unified Medical Language System: diferència entre les revisions

Contingut suprimit Contingut afegit
m ...de moment finalitzat
Robot estandarditza i catalanitza referències, catalanitza dates i fa altres canvis menors
Línia 1:
{{Infotaula de lloc web}}
El '''Sistema de Llenguatge Mèdic Unificat''' (en [[anglès]], '''''Unified Medical Language System''''', '''UMLS''') és un [[compendi]] de molts [[Vocabulari controlat|vocabularis controlats]] de les ciències [[Biomedicina|biomèdiques]], creat el 1986.<ref>{{citationcitar ref|titletítol=Unified Medical Language System|url=https://www.nlm.nih.gov/archive/20040831/pubs/cbm/umlscbm.html|yearany=1996}}</ref>
 
L'UMLS consisteix en fonts de coneixement ([[Base de dades|bases de dades]]) i un conjunt d'eines de [[programari]]; el sistema està destinat a ser utilitzat principalment per desenvolupadors de sistemes d'[[informàtica biomèdica]]. També proporciona la base per al [[Processament de llenguatge natural|processament del llenguatge natural]]; proporciona una estructura de mapatge entre aquests vocabularis i, per tant, permet traduir paraules entre els diferents sistemes de terminologia. També es pot considerar un [[tesaurus]] i un diccionari d'[[ontologia]] integral de conceptes biomèdics.
Línia 27:
 
=== ''Semantic Network'' ===
A cada concepte en el Metathesaurus s'assigna a un o més tipus semàntics (categories), que estan vinculats entre ells a través de relacions semàntiques.<ref name="UMLSRM2009Ch5">{{cite bookref-llibre| title títol= UMLS Reference Manual| publisher editorial= U.S. National Library of Medicine, National Institutes of Health| location lloc= Bethesda, MD| author autor= National Library of Medicine| year any= 2009| chapter capítol= Chapter 5 - Semantic Networks| url = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/
}}</ref> El ''Semantic Network'' ([[xarxa semàntica]]) és un catàleg d'aquests tipus i relacions semàntiques. Aquesta és una classificació bastant àmplia; en total hi ha 127 tipus semàntics i 54 relacions.
 
Línia 67:
 
== Inconsistències i altres errors ==
Donada el tamany i la complexitat de l'UMLS i la seva política permissiva sobre la integració de termes, els errors són inevitables.<ref name="MorreyEtAl2009">{{cite journalref-publicació|last1cognom1=Morrey|last2cognom2=Geller|last3cognom3=Halper|last4cognom4=Perl|titletítol=The Neighborhood Auditing Tool: A hybrid interface for auditing the UMLS|journalpublicació=Journal of Biomedical Informatics|volumevolum=42|yearany=2009|pagespàgines=468–489|doi=10.1016/j.jbi.2009.01.006|pmid=19475725|first1nom1=CP|first2nom2=J|first3nom3=M|first4nom4=Y|issueexemplar=3|pmc=2891659}}</ref> Els errors inclouen l'[[ambigüitat]] i la [[Redundància lingüística|redundància]], els cicles de relació jeràrquica (un concepte és alhora un avantpassat i un descendent), mancança d'avantpassats (els tipus semàntics de conceptes de pare/fill no estan relacionats) i la inversió semàntica (la relació de pare/fill amb els tipus semàntics és no coherent amb els conceptes).<ref>{{cite journalref-publicació|last1 cognom1= Geller| last2 cognom2= Morrey| last3 cognom3= Xu| last4 cognom4= Halper| last5 cognom5= Elhanan | last6 cognom6= Perl| last7 cognom7= Hripcsack | journal publicació= AMIA Annu Symp Proc| title títol= Comparing Inconsistent Relationship Configurations Indicating UMLS Errors| year any= 2009| volume volum= 2009| pages pàgines= 193–197| pmc = 2815406| pmid=20351848|first1 nom1= J|first2 nom2= CP|first3 nom3= J|first4 nom4= M|first5 nom5= G|first6 nom6= Y|first7 nom7= G}}</ref>
 
Aquests errors es detecten i es resolen mitjançant l'[[auditoria]] de l'UMLS. Les auditories manuals poden ser molt lentes i costoses. Els investigadors han intentat abordar el tema a través de diverses maneres. Les eines automatitzades es poden utilitzar per buscar aquests errors.
 
Per a les inconsistències estructurals (com ara [[Bucle (programació)|bucles]]), funcionaria una solució trivial basada en l'ordre. Tanmateix, aquesta solució on es pot aplicar quan la inconsistència es troba en el terme o al nivell de concepte (un significat específic d'un terme en un terme).<ref>{{cite journalref-publicació| last1 cognom1= Zhu| last2 cognom2= Fan| last3 cognom3= Baorto| last4 cognom4= Weng| last5 cognom5= Cimino| titletítol=A review of auditing methods applied to the content of controlled biomedical terminologies| journal publicació= Journal of Biomedical Informatics| pages pàgines= 413–425| year any= 2009 | doi = 10.1016/j.jbi.2009.03.003| first1 nom1= Xinxin| first2 nom2= Jung-Wei| first3 nom3= David M.| first4 nom4= Chunhua| first5 nom5= James J.| volume volum= 42| issue exemplar= 3| pmid = 19285571| pmc=3505841}}</ref> Això requereix una estratègia de recerca informada ([[representació del coneixement]]).
 
== Suport d'eines de programari ==
Línia 80:
| ''MetaMap'' - eina en línia que, quan es dóna un text arbitrari, troba i retorna els conceptes rellevants de Metathesaurus.
| ''MetaMap Transfer (MMTx)'' - Implementació de Java de MetaMap (ja no és compatible).
| ''Knowledge Source Server'' - accés als vocabularis basat en web (retirat el 2010).<ref>{{cite ref-web|titletítol=Unified Medical Language System® (UMLS®) News: Revised License Agreement, New UMLS Terminology Services and Browser, Discontinued UMLSKS, and API Changes|url=https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ja10/ja10_umls_news.html|workobra=NLM Technical Bulletin|publishereditor=U.S. National Library of Medicine|datedata= 29 Julyjuliol 2010}}</ref>
}}
 
Línia 92:
 
== Bibliografia ==
* {{cite journal ref-publicació| last1 cognom1= Bodenreider | first1 nom1= Olivier | year any= 2004 | title títol= The Unified Medical Language System (UMLS): integrating biomedical terminology | url = http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/32/suppl_1/D267 | journal publicació= Nucleic Acids Research | volume volum= 32 | issue exemplar= | pages pàgines= D267–D270 | doi = 10.1093/nar/gkh061 }}
* Kumar, Anand and Smith, Barry (2003) [http://ontology.buffalo.edu/medo/UMLS_GO.pdf The Unified Medical Language System and the Gene Ontology: Some Critical Reflections], in: KI 2003: Advances in Artificial Intelligence (Lecture Notes in Artificial Intelligence 2821), Berlin: Springer, 135–148.
* Smith, Barry Kumar, Anand and Schulze-Kremer, Steffen (2004) [http://ontology.buffalo.edu/medo/UMLS_SN.pdf Revising the UMLS Semantic Network], in M. Fieschi, et al. (eds.), Medinfo 2004, Amsterdam: IOS Press, 1700.
* {{ref-llibre| last cognom= Coiera | first nom= Enrico
* {{cite book
| year any= 2003
| last = Coiera | first = Enrico
| title títol= Guide to Health Informatics
| year = 2003
| edition edició= 2nd
| title = Guide to Health Informatics
| chapter capítol= Chapter 17 - Healthcare terminologies and classification systems
| edition = 2nd
| publisher editorial= Modder, Arnold
| chapter = Chapter 17 - Healthcare terminologies and classification systems
| publisher = Modder, Arnold
| isbn = 0-340-76425-2}}
* {{cite journalref-publicació| last1 cognom1= Mougin | first1 nom1= Fleur| last2 cognom2= Bodenreider | first2 nom2= Oliver| year any= 2005| title títol= Approaches to Eliminating Cycles in the UMLS Metathesaurus: Naïve vs. Formal| journal publicació= AMIA Annual Symposium Proceedings| pages pàgines= 550–554| pmc = 1560864| pmid=16779100}}
 
==Enllaços externs==