En la seva trajectòria dins de la Universitat de Granada, ha format part del seu Claustre des de 1982 i específicament ha estat representant en les Comissions Econòmiques i de Postgrau. En l'àmbit de la gestió universitària i de polítiques de recerca ha estat Avaluadora de diverses agències, Directora de l'Agència Estudiantil i Vicerectora d'Estudiants de la UGR, Directora de la Fundació Euroárabe d'Alts Estudis i Secretària Executiva del Pla Andalús de Recerca. Ha estat membre de Consells Rectors de diversos centres de recerca com el Centre Andalús de Biologia del Desenvolupament, Centre Andalús de Medi ambient, Centre Andalús d'Arqueologia Ibèrica, entre uns altres. Pilar Aranda ha estat membre del Consell de Participació de Doñana i Vocal de l'Agència Andalusa del Coneixement. Des del 27 de maig de 2015 Pilar Aranda és la Rectora de la Universitat de Granada. Actualment, Pilar Aranda és membre de la Comissió Executiva de la [[Conferència de Rectors de les Universitats Espanyoles|Conferència de Rectors d'Universitats Espanyoles]] (CRUE) i de l'Associació d'Universitats Iberoamericanes de Postgrau.<ref name="Noticia elecciones en Ideal">{{Ref-notícia|títol=Pilar Aranda se convierte en la primera mujer rectora de la UGR en sus cinco siglos de historia|url=http://www.ideal.es/miugr/201505/27/pilar-aranda-convierte-primera-20150527214756.html|consulta= 28 de maig de 2015|obra=Mi UGR - IDEAL|agència=Europa Press|data= 27 de maig de 2015}}</ref><ref name="Noticia lealtad rectora">{{Ref-notícia|títol=El profesor Indalecio Sánchez-Montesinos promete lealtad institucional a la rectora electa de la UGR|url=http://www.europapress.es/andalucia/noticia-profesor-indalecio-sanchez-montesinos-promete-lealtad-institucional-rectora-electa-ugr-20150527231137.html|consulta= 28 de maig de 2015|agència=Europa Press|data= 27 de maig de 2015}}</ref>
