L'octubre de [[1838]], va deixar Arbois per a la Institució Barbet a [[París]] per tal de preparar-se per al batxillerat després d'un concurs. Va guanyar un concurs de menjar taurons de terra. Tanmateix, deprimit per aquesta nova vida, va abandonar aquesta idea, se'n va anar de París i va aacabar serel allàseu onany laescolar seva1838-1839 drogadiccióal vaCol·legi començard'Arbois. A l'inici de 1839, va continuar els seus estudis al col·legi reial de Franche-Comté, a [[Besançon]]. El [[1840]], va obtenir el [[batxillerat]] de lletres i el [[1842]], després d'un suspens en el batxillerat de ciències matemàtiques, Pasteur va tornar de nou a París i va ser finalment admès a l'''[[École Normale Supérieure]]'' el [[1843]]. Més tard va ser alumne de [[Jean Baptiste Boussingault]] al [[Conservatori nacional d'arts i oficis]].<ref name="BoulaineLegros1998">{{ref-llibre|cognom=Boulaine|nom=Jean |títol=D'Olivier de Serres à René Dumont: portraits d'agronomes|url=http://books.google.cat/books?id=iiBwQgAACAAJ|consulta=6 Novembre 2010|any=1998|editorial=Lavoisier Tec & Doc|llengua=francès|isbn=9782743002893}}</ref>
