Angle díedre: diferència entre les revisions

Contingut suprimit Contingut afegit
m →‎Definicions: PNG→SVG
m Enllaços
Línia 16:
[[Fitxer:bond_dihedral_angle.svg|miniatura|Figura 2: Angle díedre definit per tres vectors d'enllaç (mostrats en vermell, verd i blau) que connecten quatre àtoms.]]
[[Fitxer:Four_atoms_dihedral_angle.svg|miniatura|Figura 3: Angle díedre definit per tres vectors d'enllaç (mostrats en vermell, verd i blau) que connecten quatre àtoms. En aquesta perspectiva, el segon vector d'enllaç (verd) vs cap a fora de la pàgina.]]
[[Fitxer:peptide_angles.png|miniatura|Figura 4: Els angles díedre de d'unes [[proteïna|proteïnes]].]]
Ja que un pla es pot definir d'unes quantes maneres (p. ex., per vectors o punts en ells, o pels seus vectors normals), hi ha unes quantes definicions equivalents d'un angle díedre.
 
Línia 46:
== Angles díedre de molècules biològiques ==
 
Els angles díedre de les cadenes de [[proteïna|proteïnes]] s'anomenen φ; (''phi'', fa referència als àtoms de la cadena C'-N-C<sup>α</sup>-C'), ψ; ''(psi'', fa referència als àtoms de la cadena N-C<sup>α</sup>-C'-N) i ω; (''omega'', fa referència als àtoms de la cadena C<sup>α</sup>-C'-N-C<sup>α</sup>). Així, φ; controlas la distància dels enllaços C'-C', ψ; controla la distància dels N-N i ω; controla la distància dels C<sup>α</sup>-C<sup>α</sup>.
 
La planitud de l'[[enllaç peptídic]] normalment restringeix <math>\omega</math> a 180° (el cas típic d'enllaç [[trans]]) o 0° (el cas rar d'enllaç [[isomeria cis-trans|cis]]). La distància entre els àtoms de C<sup>α</sup> en els ((trans i cis [[isomeria cis-trans|isòmers]] és aproximadament 3.8 i 2.9 Å, respectivament. El ''cis'' isòmer s'observa principalment en [[enllaç peptídic|enllaços peptídics]] Xaa-[[prolina|Pro]] (on Xaa és algun [[aminoàcid]]).
 
Els angles dièdrics de les cadenes laterals de [[proteïna|proteïnes]] es denoten com χ<sub>1</sub>-χ<sub>5</sub>, depenent de la distància cap amunt del sidechain. L'angle díedre de χ<sub>1</sub> està definit peles àtoms
N-C<sup>α</sup>-C<sup>β</sup>-C<sup>γ</sup>, l'angle díedre de χ<sub>2</sub> està definit pels àtoms
C<sup>α</sup>-C<sup>β</sup>-C<sup>γ</sup>-C<sup>δ</sup>, etcètera.