''Merlí'' ha despertat —juntament amb l'entusiasme per l'èxit d'audiència i la temàtica plantejada— alguns dubtes entre docents i professionals de la filosofia: s'ha qüestionat el suposat masclisme del protagonista,<ref>{{Ref-publicació|cognom=Ballús|nom=Andreu|cognom2=Arnau|nom2=Èric|article=Masclisme i estereotips de gènere a Merlí|publicació=Zena|url= http://zena.cat/masclisme-i-estereotips-de-genere-a-merli/|pàgines=}}</ref> el tractament de nous conceptes de família, l'anàlisi de la qüestió nacionalista a Catalunya, absència d'immigrants entre els alumnes i els professors,<ref>{{Ref-web|url= https://www.larazon.es/tv-y-comunicacion/tv-news/merli--la-serie-que-los-jovenes-necesitaban-CM17285016|títol="Merlí", la serie que los jóvenes necesitaban| consulta=20/8/18|nom=Cecilia|cognom=Garcia|llengua= castellà| editor=La Razón|data=25/12/17}}</ref> la manca de deontologia docent en certs moments, l'existència d'una agenda oculta en relació als conceptes filosòfics transmesos, el model de llengua que s'usa, especialment per part dels joves,<ref>{{Ref-web|títol=El model de llengua de Merlí i els peripatètics|url=https://benjamins.com/catalog/ivitra.27.02mar|consulta=2020-12-23|doi=10.1075/ivitra.27.02mar|llengua=anglès|nom=Antoni V.|cognom=Martinez Perez}}</ref> etc.<ref>{{ref-web|cognom=Cruañes|nom=Esther|url= https://www.emporda.info/fets-gent/2017/01/18/esther-cruanas-debat-sobre-merli/342422.html|títol=«En un debat sobre Merlí, vull protegir la filosofia de botox i photoshop»| consulta=|llengua=català| editor=Empordà|data=}}</ref><ref>{{ref-web |cognom=Serra |nom=Xavier |url= https://www.diaridegirona.cat/opinio/2016/12/07/merli-no-cami/818121.html | consulta=18 agost 2018 |títol=Merlí no és el camí}}</ref> Hi ha hagut força debats arreu del país <ref>{{ref-web |cognom=DdG |url= https://www.diaridegirona.cat/cultura/2017/01/26/merli-trempera-filosofica-operacio-comercial/825834.html | consulta=18 agost 2018 |títol=«Merlí»: trempera filosòfica o operació comercial del Grup Godó | editor=Diari de Girona}}</ref> i, encara que algunes crítiques han estat especialment dures,<ref>{{ref-web |cognom=Serra |nom=Xavier |url= http://www.valors.org/exit-daudiencia-agenda-oculta-per-xavier-serra/ | consulta=18 agost 2018 |títol=Èxit d'audiència. Agenda oculta? | editor=Revista Valors}}</ref> és freqüent pensar que la sèrie ha fet créixer l'interès per la filosofia i pels estudis de Grau que hi condueixen<ref>{{ref-web |cognom=Martínez |nom=Núria |url= https://www.ara.cat/societat/Merli-creixer-linteres-filosofia-estudiants_0_1674432556.html | consulta=18 agost 2018 |títol='Merlí' fa créixer l'interès per la filosofia entre els estudiants}}</ref><ref>{{ref-web|url= https://www.nuvol.com/critica/merli-letica-i-els-limits-de-la-filosofia/|títol=Merlí, l'ètica i els límits de la filosofia| consulta=18 agost 2018|nom=Eudald|cognom=Espluga| editor=Núvol|data=}}</ref><ref>{{Ref-web|url= https://www.nuvol.com/noticies/merli-gracies-per-fer-nos-pensar/|títol=Merlí. Gràcies per fer-nos pensar| consulta=20/8/18|nom=Joan|cognom=Burdeus|llengua=català| editor=Núvol|data=16/1/18}}</ref>
''Merlí'' ha tingut exit també a nivell internacional especialement gràcies a la seva presencia a Netflix.<ref>{{Ref-web|títol=Les dues referències de Merlí amb Els Simpsons|url=http://max-coma.com/2020/05/18/les-dues-referencies-de-merli-amb-els-simpsons/|consulta=2020-05-18|llengua=fr-FR|data=}}</ref>
