El 1991 la vila de Palafrugell va començar un seguit d'accions per tal d'aconseguir el llibre. El 27 de novembre de 2005 a la Mostra d'Entitats, va aconseguir 801 signatures en els diferents punts de recollida. La reclamació comptava també amb els informes favorables de l'[[Associació d'Arxivers de Catalunya]] i de la Secció d'Arxius Municipals del [[Consell Internacional d'Arxius]].<ref name="palafrugell"/>
[[Fitxer:Retorn del Llibre de Privilegis.jpg|thumb|Retorn del ''Llibre de Privilegis'' de l'[[Arxiu Municipal de Palafrugell]]. D'esquerra a dreta: [[Lluís Medir Huertasi Huerta|Lluís Medir]], [[alcalde de Palafrugell]]; [[Ferran Mascarell]], [[conseller de Cultura de la Generalitat de Catalunya]], i Xavier Rocas, regidor de Cultura]]
El 9 d'octubre de 2006 el [[conseller de Cultura de la Generalitat de Catalunya]], [[Ferran Mascarell]], i l'alcalde de Palafrugell, [[Lluís Medir Huertasi Huerta|Lluís Medir]], signaven a l'[[Arxiu Municipal de Palafrugell]] l'acord de cessió en comodat del ''Llibre de Privilegis de Palafrugell'', i el conseller dipositava aquest document a l'Arxiu. El conveni entre la Generalitat de Catalunya, la Biblioteca Nacional de Catalunya i l'Ajuntament de Palafrugell, aconseguit gràcies a la mediació de la Conselleria de Cultura, estipula que la Biblioteca Nacional de Catalunya manté la propietat del Llibre i cedeix el document a l'Arxiu en règim de comodat, per temps indefinit. En el transcurs de l'acte, el regidor de Cultura, Xavier Rocas, destacava el caràcter històric del retorn del Llibre de privilegis, el suport rebut per persones i entitats per aconseguir-lo i el caràcter moral de la reivindicació. L'alcalde, Lluís Medir, valorava la decisió final com la millor que es podia prendre i recordava l'esforç de l'Ajuntament des de 1979 per aplegar i conservar en les condicions adients la documentació, un procés que culminava amb la recuperació del Llibre. Finalment, el conseller Ferran Mascarell qualificava l'acord com a bo per al patrimoni nacional, es mostrava satisfet que Palafrugell recuperés una part de la seva memòria col·lectiva i recordava que mirar al passat és un signe de vitalitat cap al futur.<ref name="palafrugell"/>
