Tubin va néixer a Torila, tocant al [[llac Peipus]], al comtat de Tartu, [[Gubèrnia de Livònia|governació de Livònia]], llavors part de l'[[Imperi Rus]]. ElsEl seusseu parespare erenera amantspescador dei lamostrava música,gran ientusiasme elen seuparticipar pareen tocavaesdeveniments de música amateur, interpretant el [[trombó]] a l'orquestra local; mentre que la bandaseva delmare poblecontribuïa amb la seva veu al cor de l'església.<ref name="Tubinsociety">{{ref-web |url=https://www.tubinsociety.com/?page_id=707&lang=en |consulta=18 gener 2024 |títol=Biografia |editor=Societat Internacional Eduard Tubin}}</ref> El seu primer tast musical va arribar a l'escola on va aprendre la [[flauta]]. Més tard, el seu pare va canviar una vaca per un piano, i el jove Eduard aviat es va fer conegut al poble per la seva interpretació. L'Eduard també tocava la flauta a l'orquestra del poble. La infantesa de Tubina no va ser fàcil: als 10 anys va haver de sobreviure a la [[Primera Guerra Mundial]] i després a la Guerra de la Independència. Quan tenia 6 anys, el seu germà gran va morir. Poc després, el seu pare també va morir.
