El palau de Zakro va ser construït originàriament al voltant del 1900 aC, reconstruït al voltant 1600 aC<ref name= "almagro"/> i va ser destruït al voltant 1450 aC junt amb els altres centres principals de la civilització minoica.<ref name="ancient">{{ref-web|url=http://www.ancient-greece.org/archaeology/zakros.html|llengua=anglès|consulta= 7 de gener de 2014|títol=Zakros|editor= Ancient-Greece.org}}</ref>
Va ser l'arqueòleg grec [[Nikólaos Platon]] –aleshores director del [[Museu de l'Acròpoli d'Atenes]]– el 1961, qui va descobrir per complet aquesta ciutat minoica junt amb el seu palau;<ref name= "almagro">{{ref-web|nom=Martín |cognom=Almagro Basch |any=1965|url=http://descargas.cervantesvirtual.com/servlet/SirveObras/01937185106705159678813/026982.pdf?incr=1|títol=El nuevo palacio minoico de Zakro y las escrituras lineales A y B|llengua=castellà|editor Cervantes virtual|consulta= 7 de gener de 2014}}</ref> anteriorment també havien estat excavant a les proximitats arqueòlegs anglesos com el famós arqueòleg [[Arthur Evans]], però aquest no hi va trobar res. L'estructura és molt semblant a la dels altres palaus minoics: pati central envoltat pels edificis que acollien les cambres privades i els magatzems. L'entrada principal se situa en l'ala est, reservada per als allotjaments reials i estava connectada al port. L'ala oest estava ocupada pels edificis religiosos, a l'ala nord els magatzems i a la zona sud els artesans. Per la situació de Zakros i les restes trobades, es demostra que era un important centre en el comerç amb l'[[Àsia Menor]] i [[Egipte]].
