Interactòmica: diferència entre les revisions

Contingut suprimit Contingut afegit
m Robot: Reemplaçament automàtic de text (- + )
Línia 3:
==Metodes per mapejar l'interactoma==
 
Els mètodes experimentals que s'han dissenyat per a estudiar l'interactoma són 1) [[afinitat per purificació]], serveix per identificar complexes de proteïnes i 2) doble híbrids de llevat (yeast two hybrid ([[Y2H]]), s'utilitza per identificar massivament interacciones entre proteïnes.
 
Existeix un gran esforç per a escriure un mapa de l'interactome d'èssers [[eucariotes]]. S'han creat des del [[2006]] [[llevat|Llevat]], [[mosca]], [[nematode|nematodes]] i [[humà]].
 
==Bases de dades d'interactomes==
Línia 12:
*GRID database
*MIPS database
*[http://psimap.com PSIMAP] database: La primera base dades d'un interactome de proteïnes estructurals
*[http://interpare.net InterPare] database: una base de dades d'un interfaseoma de proterïnes estructurals
*Biomolecular Interaction Network Database (BIND) (Bader et al, 2003)
Línia 29:
 
== Referències ==
*Bader GD, ''et al.'' (2003) BIND: The Biomolecular interaction Network Database. Nucleic Acids Res., 31, 248-50.
*Brown KR, Jurisica I. (2005) Online Predicted Human Interaction Database. Bioinformatics, 21(9): 2076-82.
*Xenarios I, Rice DW, Salwinski L, Baron MK, Marcotte EM, Eisenberg D. (2000) DIP: the database of interacting proteins. Nucleic Acids Res. 28: 289-91.
*Peri S., Navarro JD, Amanchy R, Kristiansen TZ, Jonnalagadda CK, ''et al.'' (2003) Development of human protein reference database as an initial platform for approaching systems biology in humans. Genome Res 13:2363-71.
* Park J, Lappe M, Teichmann SA. (2001) Mapping protein family interactions: intramolecular and intermolecular protein family interaction repertoires in the PDB and yeast. J Mol Biol. 2001 Mar 30;307(3):929-38.