'''FASTA''' és un programa informàtic d'alineament d'[[àcid desoxiribonucleic|àcids desoxiribonucleics]] (ADN) i [[proteïna|proteïnes]] descrit inicialment com a FASTP per [[David J. Lipman]] i [[William R. Pearson]] el 1985 en l'article [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=2983426 ''Rapid and sensitive protein similarity searches'']. Inicialment, el programa original FASTP estava dissenyat per comparar seqüències proteïques, però més endavant, el programa FASTA, descrit el 1988<ref>{{ref-web|url= http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=3162770|títol=Improved tools for biological seque... <nowiki>[</nowiki>Proc Natl Acad Sci U S A. 1988<nowiki>]</nowiki> - PubMed - NCBI<!--Títol generat per bot-->}}</ref> va afegir la possibilitat de fer cerques ADN:ADN i proteïna:ADN, i va incorporar un mòdul addicional per a càlcular més acuradament el valor estadístic de cada comparació.
El programa FASTA es pot obtenir de [http://fasta.bioch.virginia.edu/ fasta.bioch.virginia.edu] o es poden fer cerques a través de la [http://www.ebi.ac.uk/fasta web].
